Dans le cadre d’une transplantation de cellules souches hématopoïétiques, le transfert de cellules immunologiquement compétentes du greffon à un receveur immunodéprimé peut entraîner une réaction allogénique, dite réaction du greffon contre l’hôte (GVH) qui peut être aiguë ou chronique, selon qu’elle survient avant ou après J100 post-greffe. Les différences de CMH sont les plus importants facteurs de risque d’induction de la GVH. Des stratégies ont été développées pour limiter ces réactions, notamment la prophylaxie par traitements immunosuppresseurs, en prévision d’événements immunologiques.